Dobrý den,
v prvé řadě bych se chtěl zeptat, zda máte 64-bit systém? Pokud nikoli, máte zbytečně osazeno 5 GB RAM, které systém není schopen využít (maximálně je při 32-bit systému schopen adresovat 3 GB operační paměti).
Javu není třeba spouštět - jakmile ji nainstalujete, stane se součástí běžících procesů a bude připravena pro spuštění jakéhokoli programu nebo hry, které JRE využijí (ostatně jinak byste MC ani nespustil). Nejen kvůli operační paměti doporučuji přechod na novější a hlavně 64-bit systém. Co se Javy týče, nainstalujte si její nejnovější verzi, která však bude brát zřetel jak na typ, tak verzi Vašeho operačního systému: http://mujsoubor.cz/ostatni-utility/java-runtime-environment#verze