Program VirusTotal CLI funguje jako příkazový řádek pro analýzu bezpečnosti souborů a URL adres. Kromě toho umožňuje získat informace o souborech, URL adresách, doménách a IP adresách. Pomocí VirusTotal Intelligence dokáže vyhledat soubory a URL adresy, spravovat YARA pravidla, spouštět Retrohunt joby a získat jejich výstupy. Nástroj, který nabízí tytéž funkce, jako oficiální stránka VirusTotal.